《瘟疫学》是将现代急性传染病防治与中医经典理论相结合，凸显中医药抗疫价值的课程。教学团队充分贯彻“以学生为中心”教学理念，以培养懂瘟疫、能抗疫、会研究的拔尖创新中医药人才为目标，通过更新教学理念、重构传统瘟疫课程内容、整合数字资源、扩大课程开放程度等，实现数字教育的转型，构建瘟疫学线上教学新模式，并形成了“一交叉三融合”的教学特色（“一交叉”指教学团队实现多学科交叉，“三融合”指课程古今融合、理实融合、医研融合）。
课程系统讲述了瘟疫学的形成与发展，聚焦瘟疫理论发展的学术流变特征，阐释瘟疫的病因、发病和辨证，如卫气营血辨证、三焦辨证、六经辨证、脏腑辨证、表里辨证等；以湿热疫、暑热疫、温热疫、寒（湿）疫和杂疫为纲，既有每类瘟疫的源流、代表性医家学术思想和临床防治，又有吴又可《温疫论》、余师愚《疫疹一得》、杨栗山《伤寒瘟疫条辨》、刘松峰《松峰说疫》，还有新冠病毒病、流感、SARS、人感染猪链球菌等的中医药因证脉治及中医药在抗疫实战中的生动案例等。
《瘟疫学》课程获得了教育部中医学类教指委主任委员、温病学课程联盟理事长谷晓红教授，教育部中医学类教指委副主任委员、福建中医药大学校长李灿东教授的高度肯定和赞扬，评价“该课程对全国中医药院校的中医疫病学教学起到了积极示范作用”。
